Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FDFT1P37268 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms