Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPB2P35606 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPB2P35606 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB2P35606 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB2P35606 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB2P35606 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB2P35606 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB2P35606 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB2P35606 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB2P35606 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB2P35606 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB2P35606 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB2P35606 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms