Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OTX2P32243 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OTX2P32243 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTX2P32243 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
OTX2P32243 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
OTX2P32243 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
OTX2P32243 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTX2P32243 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTX2P32243 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTX2P32243 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTX2P32243 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTX2P32243 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTX2P32243 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTX2P32243 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTX2P32243 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTX2P32243 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTX2P32243 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTX2P32243 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTX2P32243 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTX2P32243 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTX2P32243 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTX2P32243 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms