Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXA13P31271 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms