Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP1P29466 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASP1P29466 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP1P29466 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP1P29466 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP1P29466 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASP1P29466 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP1P29466 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP1P29466 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP1P29466 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP1P29466 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP1P29466 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP1P29466 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASP1P29466 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms