Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTGFP29279 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTGFP29279 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTGFP29279 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTGFP29279 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTGFP29279 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTGFP29279 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTGFP29279 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTGFP29279 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTGFP29279 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTGFP29279 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTGFP29279 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTGFP29279 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTGFP29279 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTGFP29279 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTGFP29279 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTGFP29279 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTGFP29279 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTGFP29279 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTGFP29279 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTGFP29279 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTGFP29279 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTGFP29279 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTGFP29279 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTGFP29279 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTGFP29279 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTGFP29279 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTGFP29279 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTGFP29279 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTGFP29279 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTGFP29279 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTGFP29279 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTGFP29279 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTGFP29279 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTGFP29279 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTGFP29279 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTGFP29279 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTGFP29279 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTGFP29279 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTGFP29279 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTGFP29279 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTGFP29279 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTGFP29279 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTGFP29279 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTGFP29279 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTGFP29279 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTGFP29279 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTGFP29279 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms