Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LMO2P25791 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMO2P25791 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMO2P25791 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMO2P25791 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMO2P25791 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMO2P25791 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMO2P25791 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LMO2P25791 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LMO2P25791 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMO2P25791 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMO2P25791 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMO2P25791 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LMO2P25791 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMO2P25791 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMO2P25791 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMO2P25791 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMO2P25791 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMO2P25791 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMO2P25791 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LMO2P25791 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
LMO2P25791 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMO2P25791 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMO2P25791 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMO2P25791 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMO2P25791 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LMO2P25791 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMO2P25791 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMO2P25791 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMO2P25791 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMO2P25791 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMO2P25791 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMO2P25791 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMO2P25791 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMO2P25791 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMO2P25791 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMO2P25791 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMO2P25791 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms