Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS6KB1P23443 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KB1P23443 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms