Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGFR3P22607 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGFR3P22607 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms