Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCP2P22307 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCP2P22307 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCP2P22307 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCP2P22307 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCP2P22307 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCP2P22307 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SCP2P22307 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCP2P22307 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCP2P22307 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCP2P22307 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCP2P22307 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCP2P22307 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCP2P22307 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCP2P22307 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCP2P22307 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms