Protein–RNA interactions for Protein: P22217

TRX1, Thioredoxin-1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRX1P22217 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.74□□□□□ -2.29
TRX1P22217 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.74□□□□□ -2.29
TRX1P22217 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.74□□□□□ -2.29
TRX1P22217 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.74□□□□□ -2.29
TRX1P22217 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.74□□□□□ -2.29
TRX1P22217 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.74□□□□□ -2.29
TRX1P22217 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.74□□□□□ -2.29
TRX1P22217 YKL083WYKL083W 615 nt0.74□□□□□ -2.29
TRX1P22217 YNL303WYNL303W 348 nt0.74□□□□□ -2.29
TRX1P22217 YOR029WYOR029W 336 nt0.74□□□□□ -2.29
TRX1P22217 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.74□□□□□ -2.29
TRX1P22217 NOP9YJL010C 2001 nt0.73□□□□□ -2.29
TRX1P22217 YAP6YDR259C 1152 nt0.73□□□□□ -2.29
TRX1P22217 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.73□□□□□ -2.29
TRX1P22217 YAR047CYAR047C 321 nt0.73□□□□□ -2.29
TRX1P22217 RPL38YLR325C 237 nt0.72□□□□□ -2.29
TRX1P22217 ATP19YOL077W-A 207 nt0.72□□□□□ -2.29
TRX1P22217 snR41snR41 95 nt0.72□□□□□ -2.29
TRX1P22217 PTP2YOR208W 2253 nt0.72□□□□□ -2.29
TRX1P22217 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.71□□□□□ -2.3
TRX1P22217 RPS30BYOR182C 192 nt0.71□□□□□ -2.3
TRX1P22217 YLL007CYLL007C 1998 nt0.7□□□□□ -2.3
TRX1P22217 TOM22YNL131W 459 nt0.7□□□□□ -2.3
TRX1P22217 BFR2YDR299W 1605 nt0.69□□□□□ -2.3
TRX1P22217 YHL041WYHL041W 450 nt0.69□□□□□ -2.3
TRX1P22217 RPS24BYIL069C 408 nt0.69□□□□□ -2.3
TRX1P22217 MAM33YIL070C 801 nt0.69□□□□□ -2.3
TRX1P22217 INA22YIR024C 651 nt0.69□□□□□ -2.3
TRX1P22217 RPL26AYLR344W 384 nt0.69□□□□□ -2.3
TRX1P22217 ISF1YMR081C 1017 nt0.69□□□□□ -2.3
TRX1P22217 OST1YJL002C 1431 nt0.69□□□□□ -2.3
TRX1P22217 YCK3YER123W 1575 nt0.69□□□□□ -2.3
TRX1P22217 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.68□□□□□ -2.3
TRX1P22217 UBP3YER151C 2739 nt0.67□□□□□ -2.3
TRX1P22217 ECM12YHR021W-A 456 nt0.67□□□□□ -2.3
TRX1P22217 YPL044CYPL044C 549 nt0.67□□□□□ -2.3
TRX1P22217 IQG1YPL242C 4488 nt0.67□□□□□ -2.3
TRX1P22217 PCF11YDR228C 1881 nt0.67□□□□□ -2.3
TRX1P22217 YLR456WYLR456W 615 nt0.66□□□□□ -2.3
TRX1P22217 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.66□□□□□ -2.3
TRX1P22217 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
TRX1P22217 YJR011CYJR011C 786 nt0.65□□□□□ -2.31
TRX1P22217 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.65□□□□□ -2.31
TRX1P22217 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.65□□□□□ -2.31
TRX1P22217 BEM3YPL115C 3387 nt0.64□□□□□ -2.31
TRX1P22217 YBR064WYBR064W 429 nt0.64□□□□□ -2.31
TRX1P22217 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.64□□□□□ -2.31
TRX1P22217 YSP1YHR155W 3687 nt0.63□□□□□ -2.31
TRX1P22217 CHS6YJL099W 2241 nt0.63□□□□□ -2.31
TRX1P22217 GEA2YEL022W 4380 nt0.62□□□□□ -2.31
TRX1P22217 YMR160WYMR160W 2451 nt0.61□□□□□ -2.31
TRX1P22217 YOR218CYOR218C 420 nt0.61□□□□□ -2.31
TRX1P22217 YBR206WYBR206W 324 nt0.61□□□□□ -2.31
TRX1P22217 NPR2YEL062W 1848 nt0.61□□□□□ -2.31
TRX1P22217 OLI1Q0130 231 nt0.6□□□□□ -2.31
TRX1P22217 YJL007CYJL007C 315 nt0.6□□□□□ -2.31
TRX1P22217 YKL063CYKL063C 504 nt0.6□□□□□ -2.31
TRX1P22217 PAA1YDR071C 576 nt0.59□□□□□ -2.31
TRX1P22217 YDR344CYDR344C 444 nt0.57□□□□□ -2.32
TRX1P22217 BUD3YCL014W 4911 nt0.57□□□□□ -2.32
TRX1P22217 SPO21YOL091W 1830 nt0.57□□□□□ -2.32
TRX1P22217 BSC3YLR465C 309 nt0.56□□□□□ -2.32
TRX1P22217 YML002WYML002W 2214 nt0.56□□□□□ -2.32
TRX1P22217 PCC1YKR095W-A 267 nt0.55□□□□□ -2.32
TRX1P22217 MCM10YIL150C 1716 nt0.55□□□□□ -2.32
TRX1P22217 MLP2YIL149C 5040 nt0.55□□□□□ -2.32
TRX1P22217 ASE1YOR058C 2658 nt0.54□□□□□ -2.32
TRX1P22217 YDR426CYDR426C 378 nt0.54□□□□□ -2.32
TRX1P22217 RPL26BYGR034W 384 nt0.53□□□□□ -2.32
TRX1P22217 YOR053WYOR053W 342 nt0.53□□□□□ -2.32
TRX1P22217 HAL9YOL089C 3093 nt0.53□□□□□ -2.33
TRX1P22217 MLP1YKR095W 5628 nt0.52□□□□□ -2.33
TRX1P22217 HMRA2YCR096C 360 nt0.52□□□□□ -2.33
TRX1P22217 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.52□□□□□ -2.33
TRX1P22217 FYV10YIL097W 1551 nt0.52□□□□□ -2.33
TRX1P22217 UTP10YJL109C 5310 nt0.51□□□□□ -2.33
TRX1P22217 YLR434CYLR434C 384 nt0.5□□□□□ -2.33
TRX1P22217 SEC8YPR055W 3198 nt0.5□□□□□ -2.33
TRX1P22217 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.49□□□□□ -2.33
TRX1P22217 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.48□□□□□ -2.33
TRX1P22217 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.48□□□□□ -2.33
TRX1P22217 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.48□□□□□ -2.33
TRX1P22217 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.48□□□□□ -2.33
TRX1P22217 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.48□□□□□ -2.33
TRX1P22217 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.48□□□□□ -2.33
TRX1P22217 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.48□□□□□ -2.33
TRX1P22217 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.48□□□□□ -2.33
TRX1P22217 VPS20YMR077C 666 nt0.48□□□□□ -2.33
TRX1P22217 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.47□□□□□ -2.33
TRX1P22217 FMP27YLR454W 7887 nt0.46□□□□□ -2.34
TRX1P22217 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.46□□□□□ -2.34
TRX1P22217 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.46□□□□□ -2.34
TRX1P22217 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.46□□□□□ -2.34
TRX1P22217 UTP20YBL004W 7482 nt0.46□□□□□ -2.34
TRX1P22217 YLR334CYLR334C 381 nt0.44□□□□□ -2.34
TRX1P22217 YPL068CYPL068C 882 nt0.44□□□□□ -2.34
TRX1P22217 YPL205CYPL205C 345 nt0.44□□□□□ -2.34
TRX1P22217 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.43□□□□□ -2.34
TRX1P22217 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.43□□□□□ -2.34
TRX1P22217 YNL211CYNL211C 261 nt0.43□□□□□ -2.34
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