Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EGR1P18146 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EGR1P18146 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EGR1P18146 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EGR1P18146 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms