Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF7P17544 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATF7P17544 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF7P17544 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF7P17544 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF7P17544 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF7P17544 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms