Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP2A2P16615 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2A2P16615 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms