Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA1P14867 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA1P14867 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms