Protein–RNA interactions for Protein: P13985

HRES1, Putative HTLV-1-related endogenous sequence, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRES1P13985 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HRES1P13985 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
HRES1P13985 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRES1P13985 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRES1P13985 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRES1P13985 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRES1P13985 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRES1P13985 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRES1P13985 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRES1P13985 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRES1P13985 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRES1P13985 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRES1P13985 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRES1P13985 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRES1P13985 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRES1P13985 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRES1P13985 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HRES1P13985 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms