Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ODC1P11926 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODC1P11926 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ODC1P11926 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ODC1P11926 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ODC1P11926 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODC1P11926 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODC1P11926 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODC1P11926 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODC1P11926 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODC1P11926 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ODC1P11926 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODC1P11926 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODC1P11926 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ODC1P11926 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms