Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SAA2P0DJI9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SAA2P0DJI9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms