Protein–RNA interactions for Protein: P0CX84

RPL35A, 60S ribosomal protein L35-A, yeast

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL35A	P0CX84	snR45	snR45	172 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
RPL35A	P0CX84	PRP42	YDR235W	1635 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
RPL35A	P0CX84	OLI1	Q0130	231 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
RPL35A	P0CX84	YAL066W	YAL066W	309 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
RPL35A	P0CX84	YMR141W-A	YMR141W-A	225 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
RPL35A	P0CX84	YBR076C-A	YBR076C-A	267 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
RPL35A	P0CX84	RAD34	YDR314C	2079 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
RPL35A	P0CX84	PRP5	YBR237W	2550 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
RPL35A	P0CX84	YPL182C	YPL182C	384 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	PRP39	YML046W	1890 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	PAA1	YDR071C	576 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	COX5B	YIL111W	456 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	PRP21	YJL203W	843 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	PBI2	YNL015W	228 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	YBR064W	YBR064W	429 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	MCM10	YIL150C	1716 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	YAP6	YDR259C	1152 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	YIL066W-A	YIL066W-A	444 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	YIR018C-A	YIR018C-A	138 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	YOR053W	YOR053W	342 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	IPP1	YBR011C	864 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	COG8	YML071C	1824 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	UTP8	YGR128C	2142 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	HUR1	YGL168W	333 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	YOR192C-B	YOR192C-B	5313 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	SPO21	YOL091W	1830 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	YGR025W	YGR025W	303 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	YLR232W	YLR232W	348 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
RPL35A	P0CX84	YER135C	YER135C	393 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	ASE1	YOR058C	2658 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	PTP2	YOR208W	2253 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	snR72	snR72	98 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	YKL044W	YKL044W	321 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	YLR198C	YLR198C	360 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	YBL008W-A	YBL008W-A	240 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	snR190	snR190	190 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	RCO1	YMR075W	2055 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	TSC3	YBR058C-A	243 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	YDL016C	YDL016C	303 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	OST4	YDL232W	111 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	YPR160W-A	YPR160W-A	81 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	SNU56	YDR240C	1479 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	TIM13	YGR181W	318 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	HAL9	YOL089C	3093 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	EMC4	YGL231C	573 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	YAL067W-A	YAL067W-A	228 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	YLR399W-A	YLR399W-A	105 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	YOR186C-A	YOR186C-A	210 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	snR51	snR51	107 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
RPL35A	P0CX84	RPL35A	YDL191W	363 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	ULI1	YFR026C	510 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	MRPL50	YNR022C	420 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	SSS1	YDR086C	243 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	ORC3	YLL004W	1851 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	BER1	YLR412W	825 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	YDR210W	YDR210W	228 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	YAR053W	YAR053W	297 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	HMLALPHA2	YCL067C	633 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	MATALPHA2	YCR039C	633 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	YDR371C-A	YDR371C-A	105 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	YML108W	YML108W	318 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	DCP1	YOL149W	696 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	YCR001W	YCR001W	315 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	YBR206W	YBR206W	324 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	YFR012W-A	YFR012W-A	87 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	RPS26A	YGL189C	360 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	MAM33	YIL070C	801 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	YKL136W	YKL136W	399 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
RPL35A	P0CX84	SDH7	YDR511W	402 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
RPL35A	P0CX84	NFU1	YKL040C	771 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
RPL35A	P0CX84	TFB5	YDR079C-A	219 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
RPL35A	P0CX84	RPS20	YHL015W	366 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
RPL35A	P0CX84	SEM1	YDR363W-A	270 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
RPL35A	P0CX84	YHL046W-A	YHL046W-A	327 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
RPL35A	P0CX84	LEE1	YPL054W	906 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
RPL35A	P0CX84	GRX5	YPL059W	453 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
RPL35A	P0CX84	YJR011C	YJR011C	786 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
RPL35A	P0CX84	YNL058C	YNL058C	951 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
RPL35A	P0CX84	NNF2	YGR089W	2811 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
RPL35A	P0CX84	YFR009W-A	YFR009W-A	258 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
RPL35A	P0CX84	YNL211C	YNL211C	261 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
RPL35A	P0CX84	ATG31	YDR022C	591 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
RPL35A	P0CX84	YJR141W	YJR141W	1044 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
RPL35A	P0CX84	YLR171W	YLR171W	390 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
RPL35A	P0CX84	YNL146W	YNL146W	303 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
RPL35A	P0CX84	YOR345C	YOR345C	351 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
RPL35A	P0CX84	SOV1	YMR066W	2697 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
RPL35A	P0CX84	CSE1	YGL238W	2883 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
RPL35A	P0CX84	RPF1	YHR088W	888 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
RPL35A	P0CX84	YJL047C-A	YJL047C-A	135 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
RPL35A	P0CX84	YDL011C	YDL011C	324 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
RPL35A	P0CX84	YJL020W-A	YJL020W-A	258 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
RPL35A	P0CX84	YPL229W	YPL229W	621 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
RPL35A	P0CX84	NIP1	YMR309C	2439 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
RPL35A	P0CX84	YGR164W	YGR164W	336 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
RPL35A	P0CX84	YBL071C	YBL071C	309 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
RPL35A	P0CX84	COY1	YKL179C	2040 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
RPL35A	P0CX84	YHL041W	YHL041W	450 nt		-0.36	□□□□□ -2.47

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