Protein–RNA interactions for Protein: P0C2J7

TY4B-H, Transposon Ty4-H Gag-Pol polyprotein, yeast

Predictions only

Length 1,802 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY4B-H	P0C2J7	SDS22	YKL193C	1017 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	DCP1	YOL149W	696 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	RPS27A	YKL156W	249 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	YMR141W-A	YMR141W-A	225 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	YPL185W	YPL185W	396 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	SBH2	YER019C-A	267 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	YPR160W-A	YPR160W-A	81 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	RAD34	YDR314C	2079 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	YER076W-A	YER076W-A	348 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	YFR012W-A	YFR012W-A	87 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	YLR217W	YLR217W	324 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	YBR206W	YBR206W	324 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	snR5	snR5	204 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	YDR269C	YDR269C	324 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	EMC4	YGL231C	573 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	SOV1	YMR066W	2697 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	YDL187C	YDL187C	330 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
TY4B-H	P0C2J7	snR8	snR8	190 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	YDR371C-A	YDR371C-A	105 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	ILM1	YJR118C	612 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	HTB2	YBL002W	396 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	BUD26	YDR241W	288 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	YLR399W-A	YLR399W-A	105 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	NIP1	YMR309C	2439 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	MCM10	YIL150C	1716 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	HUR1	YGL168W	333 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	YLR101C	YLR101C	396 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	PBI2	YNL015W	228 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	YPL225W	YPL225W	441 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	EFR3	YMR212C	2349 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	YAP6	YDR259C	1152 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	YER138W-A	YER138W-A	105 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	YBL062W	YBL062W	381 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	OST4	YDL232W	111 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	YGR115C	YGR115C	780 nt		-0.31	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	YGL015C	YGL015C	393 nt		-0.32	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	RPS26A	YGL189C	360 nt		-0.32	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	YKU70	YMR284W	1809 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	YAL067W-A	YAL067W-A	228 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	YNL146W	YNL146W	303 nt		-0.33	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	NFU1	YKL040C	771 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	UBS1	YBR165W	834 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	YKL202W	YKL202W	582 nt		-0.34	□□□□□ -2.46
TY4B-H	P0C2J7	YGL239C	YGL239C	315 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YLR198C	YLR198C	360 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	TIM13	YGR181W	318 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YIR021W-A	YIR021W-A	213 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YPL261C	YPL261C	309 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	snR51	snR51	107 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	MRPL32	YCR003W	552 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	PAA1	YDR071C	576 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	ECM9	YKR004C	1134 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YJR011C	YJR011C	786 nt		-0.37	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		-0.37	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YLR171W	YLR171W	390 nt		-0.37	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YIL066W-A	YIL066W-A	444 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YBL107W-A	YBL107W-A	105 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	snR128	snR128	126 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YGR228W	YGR228W	345 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YNR077C	YNR077C	255 nt		-0.38	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.39	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YEL073C	YEL073C	324 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YHL046W-A	YHL046W-A	327 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YOL029C	YOL029C	606 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YPR039W	YPR039W	336 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	SNU56	YDR240C	1479 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	COY1	YKL179C	2040 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	YOR011W-A	YOR011W-A	207 nt		-0.41	□□□□□ -2.47
TY4B-H	P0C2J7	snR72	snR72	98 nt		-0.41	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	SEM1	YDR363W-A	270 nt		-0.41	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	SPO21	YOL091W	1830 nt		-0.41	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	APQ13	YJL075C	417 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	YPT6	YLR262C	648 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	YPR170W-A	YPR170W-A	186 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	YJL020W-A	YJL020W-A	258 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	YIR044C	YIR044C	186 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	YML108W	YML108W	318 nt		-0.43	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	YER175W-A	YER175W-A	165 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	SEC10	YLR166C	2616 nt		-0.44	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	YDL185C-A	YDL185C-A	228 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	YER135C	YER135C	393 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	RPS20	YHL015W	366 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	RAD61	YDR014W	1944 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	ATG31	YDR022C	591 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	YDR210W	YDR210W	228 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	YHL041W	YHL041W	450 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	YLL006W-A	YLL006W-A	177 nt		-0.45	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	PTP2	YOR208W	2253 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	YGR025W	YGR025W	303 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	ECL1	YGR146C	636 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	POP7	YBR167C	423 nt		-0.46	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	YMR254C	YMR254C	309 nt		-0.47	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	TSC3	YBR058C-A	243 nt		-0.47	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	RPM2	YML091C	3609 nt		-0.47	□□□□□ -2.48
TY4B-H	P0C2J7	snR9	snR9	187 nt		-0.48	□□□□□ -2.49
TY4B-H	P0C2J7	YLR412C-A	YLR412C-A	207 nt		-0.48	□□□□□ -2.49
TY4B-H	P0C2J7	YMR307C-A	YMR307C-A	195 nt		-0.48	□□□□□ -2.49
TY4B-H	P0C2J7	YOR345C	YOR345C	351 nt		-0.48	□□□□□ -2.49
TY4B-H	P0C2J7	CMC1	YKL137W	336 nt		-0.48	□□□□□ -2.49

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