Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC175P0C221 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms