Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACAA1P09110 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACAA1P09110 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms