Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG7O95352 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG7O95352 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG7O95352 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG7O95352 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG7O95352 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG7O95352 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG7O95352 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG7O95352 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG7O95352 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG7O95352 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG7O95352 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG7O95352 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG7O95352 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG7O95352 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG7O95352 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG7O95352 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG7O95352 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG7O95352 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG7O95352 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG7O95352 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG7O95352 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG7O95352 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG7O95352 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG7O95352 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG7O95352 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG7O95352 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG7O95352 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG7O95352 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG7O95352 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG7O95352 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG7O95352 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG7O95352 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG7O95352 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG7O95352 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG7O95352 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG7O95352 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG7O95352 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG7O95352 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG7O95352 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG7O95352 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG7O95352 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG7O95352 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG7O95352 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG7O95352 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG7O95352 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG7O95352 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG7O95352 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG7O95352 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms