Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
USP19O94966 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP19O94966 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP19O94966 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP19O94966 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP19O94966 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP19O94966 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP19O94966 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP19O94966 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP19O94966 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP19O94966 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP19O94966 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP19O94966 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP19O94966 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP19O94966 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP19O94966 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP19O94966 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
USP19O94966 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP19O94966 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP19O94966 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP19O94966 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP19O94966 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP19O94966 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP19O94966 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP19O94966 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP19O94966 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP19O94966 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
USP19O94966 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP19O94966 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP19O94966 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP19O94966 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP19O94966 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP19O94966 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP19O94966 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP19O94966 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP19O94966 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP19O94966 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP19O94966 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP19O94966 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP19O94966 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP19O94966 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP19O94966 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP19O94966 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP19O94966 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP19O94966 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP19O94966 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP19O94966 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP19O94966 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP19O94966 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP19O94966 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP19O94966 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP19O94966 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP19O94966 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP19O94966 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP19O94966 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP19O94966 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP19O94966 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP19O94966 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP19O94966 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP19O94966 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP19O94966 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP19O94966 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP19O94966 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP19O94966 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP19O94966 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP19O94966 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP19O94966 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP19O94966 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP19O94966 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP19O94966 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP19O94966 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP19O94966 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
USP19O94966 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP19O94966 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP19O94966 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP19O94966 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP19O94966 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP19O94966 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP19O94966 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP19O94966 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP19O94966 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP19O94966 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP19O94966 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP19O94966 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP19O94966 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP19O94966 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP19O94966 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP19O94966 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP19O94966 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP19O94966 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP19O94966 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms