Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LGR5O75473 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LGR5O75473 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LGR5O75473 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR5O75473 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR5O75473 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR5O75473 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR5O75473 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR5O75473 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR5O75473 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR5O75473 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR5O75473 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR5O75473 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR5O75473 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR5O75473 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR5O75473 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR5O75473 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR5O75473 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LGR5O75473 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGR5O75473 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR5O75473 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR5O75473 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR5O75473 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR5O75473 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR5O75473 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR5O75473 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGR5O75473 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms