Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSVO60911 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTSVO60911 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTSVO60911 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CTSVO60911 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTSVO60911 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTSVO60911 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTSVO60911 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTSVO60911 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTSVO60911 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTSVO60911 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTSVO60911 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSVO60911 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSVO60911 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSVO60911 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSVO60911 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSVO60911 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSVO60911 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTSVO60911 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms