Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRKAB2O43741 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKAB2O43741 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms