Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DENRO43583 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DENRO43583 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DENRO43583 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms