Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MTSS1O43312 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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