Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIK3CDO00329 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms