Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3KR12 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3KR12 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
J3KR12 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
J3KR12 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3KR12 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3KR12 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3KR12 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
J3KR12 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms