Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L12C9JPN9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L12C9JPN9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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