Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC69A6NI79 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC69A6NI79 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms