Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HELTA6NFD8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HELTA6NFD8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms