Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GOLGA6L9A6NEM1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms