Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GOLGA6CA6NDK9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GOLGA6CA6NDK9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms