Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF826P-204ENST00000597334 1446 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP39A1-201ENST00000275016 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC26-210ENST00000495038 1599 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1257-205ENST00000515659 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ3-202ENST00000369240 646 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLV3-19-201ENST00000390309 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL627402.1-201ENST00000405276 735 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST13P13-201ENST00000417082 1092 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBMY2GP-201ENST00000418671 1034 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009495.3-201ENST00000425688 779 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF7-IT1-201ENST00000428777 655 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBMY2NP-201ENST00000434454 1028 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR3B1P-201ENST00000437536 893 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138881.1-201ENST00000443445 789 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL669970.1-201ENST00000444936 450 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016700.3-201ENST00000455541 448 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL5P1-201ENST00000460716 894 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL397P-201ENST00000487309 298 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL34P-201ENST00000497296 270 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM161B-207ENST00000509387 963 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091839.1-201ENST00000513087 269 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244502.1-205ENST00000535351 571 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003002.1-201ENST00000543226 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM106C-212ENST00000549288 321 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCED1B-AS1-209ENST00000552269 673 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRMP2-201ENST00000553832 916 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL392023.2-201ENST00000554687 785 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004816.1-202ENST00000557691 629 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087481.1-201ENST00000561684 965 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL118P-201ENST00000580570 302 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00649-209ENST00000597626 612 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.74-201ENST00000614973 284 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GZMB-209ENST00000616551 559 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHAG-203ENST00000618248 1203 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C20orf78-202ENST00000623418 606 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005086.2-201ENST00000624939 228 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073488.8-201ENST00000631952 757 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPN-205ENST00000439957 1699 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND11-216ENST00000602682 1687 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR10J3-201ENST00000332217 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC12B-201ENST00000338896 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNLL1-202ENST00000392508 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APLF-202ENST00000394342 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104455.1-201ENST00000417340 736 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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