Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

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Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 IFT43-201ENST00000238628 816 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 MS4A2-201ENST00000278888 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 OR13H1-201ENST00000338616 927 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 RNA5SP71-201ENST00000362967 126 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 RNU4-59P-201ENST00000364447 116 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 OR2AK2-201ENST00000366480 1154 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR654-201ENST00000385199 81 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 RPL24-201ENST00000394077 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 VDAC1P8-201ENST00000406025 853 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 RBMY2FP-202ENST00000420346 1263 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 RPL7P7-201ENST00000428803 703 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 FGF12-206ENST00000450716 768 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AZI2-207ENST00000457172 1136 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01888-202ENST00000457602 574 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 RPL12P40-201ENST00000467028 488 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC098583.2-201ENST00000504151 372 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 CTHRC1-203ENST00000520337 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 FXYD2-206ENST00000532119 562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC02296-201ENST00000557070 544 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC02544-201ENST00000564830 544 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR3714-201ENST00000579507 65 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF585B-207ENST00000586320 403 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF611-214ENST00000600943 560 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC016999.2-201ENST00000614692 556 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 WDR11-AS1-207ENST00000630905 769 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC00934-202ENST00000630357 2291 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AL022334.1-201ENST00000417397 1726 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 STX2-203ENST00000392373 2151 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 ADH7-205ENST00000482593 1420 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 CASP10-201ENST00000272879 2073 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 TATDN2P1-201ENST00000443767 2331 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AP000705.2-201ENST00000433524 1386 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC106800.1-201ENST00000501221 1362 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 PSG9-203ENST00000291752 1055 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 OR1J4-201ENST00000340750 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AL080285.1-201ENST00000404225 984 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC008770.1-201ENST00000406892 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC004009.1-201ENST00000412413 567 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 NIF3L1-206ENST00000416651 967 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC127537.1-201ENST00000418183 748 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AL162724.2-201ENST00000426157 308 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 KRTAP9-11P-201ENST00000431013 525 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC019055.1-201ENST00000432822 443 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AL353615.1-201ENST00000450850 390 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC034232.2-201ENST00000511579 917 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 C14orf159-210ENST00000518665 959 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 IGHVIII-82-201ENST00000522058 250 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01608-202ENST00000524283 561 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 PRPSAP2-217ENST00000542013 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM106C-219ENST00000552546 742 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC005230.1-201ENST00000555418 285 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 FDPSP3-201ENST00000556903 1013 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 SAXO2-204ENST00000565432 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC004224.2-201ENST00000574423 529 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 RN7SL123P-201ENST00000577239 292 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC010618.3-203ENST00000595116 313 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF83-210ENST00000597161 509 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCNB1IP1Q9NPC3 AC006115.1-201ENST00000599726 517 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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