Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PART1-203ENST00000515734 2569 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CORIN-205ENST00000504584 2417 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 FAM107B-201ENST00000181796 3785 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ZNF85-202ENST00000328178 2296 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 TMCO5A-201ENST00000319669 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 OR5P3-201ENST00000328375 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC234778.1-201ENST00000399253 370 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL356432.2-201ENST00000407841 422 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 OCM-202ENST00000416608 623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AKR1B1P8-201ENST00000418396 936 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CDH13-203ENST00000431540 831 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC009988.1-201ENST00000434988 310 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 YWHABP1-201ENST00000445359 727 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 OR7A15P-201ENST00000449848 1009 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RN7SL856P-201ENST00000461754 298 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RN7SL135P-201ENST00000490144 278 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC112203.1-201ENST00000506315 1020 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC226119.2-201ENST00000513501 530 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC107220.1-201ENST00000514347 1037 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RN7SKP197-201ENST00000517077 297 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 C11orf70-202ENST00000526781 845 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 OR4A7P-201ENST00000531463 910 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 TMEM269-202ENST00000536543 983 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC137767.1-202ENST00000543072 752 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC069235.1-202ENST00000545535 540 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC02345-202ENST00000558081 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CDH13-207ENST00000565636 810 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC004224.2-201ENST00000574423 529 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC105243.1-202ENST00000583942 847 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC00663-205ENST00000589508 432 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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PDCD1Q15116 OSGIN2-201ENST00000297438 4209 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 HHLA2-205ENST00000467562 1457 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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PDCD1Q15116 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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PDCD1Q15116 AL136985.3-201ENST00000637377 2219 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PARP15-201ENST00000310366 1518 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 SAXO1-203ENST00000542071 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PSMC1-202ENST00000543772 1389 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC092999.1-201ENST00000624004 1924 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MAPK10-204ENST00000395157 2665 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CWC27-204ENST00000508024 2103 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PSG9-205ENST00000443718 1421 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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