Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA6L17P-201ENST00000611297 586 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILK-216ENST00000627400 111 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3150A-201ENST00000636546 80 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM238A-202ENST00000637359 442 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL021396.1-202ENST00000457707 1929 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAOK3-209ENST00000537952 2147 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUSAP1-203ENST00000450592 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026765.2-201ENST00000551875 1330 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSRC1-202ENST00000312179 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FABP1-201ENST00000295834 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA5C-201ENST00000364902 137 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FETUB-202ENST00000382134 1055 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP169-201ENST00000411124 291 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAI2P2-201ENST00000417003 916 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPLP1P13-201ENST00000434567 299 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012494.1-201ENST00000439259 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB20-AS4-201ENST00000472323 675 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL586P-201ENST00000479137 296 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL745P-201ENST00000484900 299 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109588.1-202ENST00000515720 880 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP105-201ENST00000517192 314 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPLA1-213ENST00000522007 250 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDHD-203ENST00000526592 861 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005135.1-201ENST00000532071 714 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC060814.3-201ENST00000557717 460 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100826.1-201ENST00000558010 890 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104770.1-202ENST00000573698 325 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015878.2-201ENST00000584331 361 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF3K-211ENST00000592558 670 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109954.1-201ENST00000619495 557 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031291.1-201ENST00000641979 742 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002540.1-201ENST00000625023 1349 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF816-203ENST00000357666 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAALAD2-204ENST00000525171 1613 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC4C-201ENST00000354629 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNST-201ENST00000366511 645 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAS1L-201ENST00000377127 1260 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1AKMT1-202ENST00000382758 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA74B-201ENST00000391100 201 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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