Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 FAF2P1-201ENST00000429974 1298 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 CDH13-203ENST00000431540 831 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 RBMY2NP-201ENST00000434454 1028 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AC016734.1-201ENST00000436998 654 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AC074286.1-202ENST00000441205 567 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 LINC01888-202ENST00000457602 574 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 FTH1P23-201ENST00000492727 550 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AC027607.1-201ENST00000503034 534 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 GAPDHP61-201ENST00000507324 1005 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 LINC01608-202ENST00000524283 561 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 KCTD21-AS1-204ENST00000528468 554 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 FXYD2-206ENST00000532119 562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 PRPSAP2-217ENST00000542013 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AC005230.1-201ENST00000555418 285 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 PSMA3-AS1-210ENST00000556002 1039 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AC027020.1-201ENST00000559349 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 CDH13-207ENST00000565636 810 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AC006547.1-208ENST00000598339 805 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AC138035.1-203ENST00000604354 1066 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AL451085.1-201ENST00000604546 690 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 OR13Z2P-201ENST00000606338 555 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AP002856.2-202ENST00000606885 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 CU638689.4-203ENST00000625185 785 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AL356599.1-202ENST00000626919 218 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 LINC01359-205ENST00000634604 1050 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 MMP20-201ENST00000260228 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AC024610.2-203ENST00000636084 1348 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 GCSAML-204ENST00000463359 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AC005840.3-201ENST00000541888 1803 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 SMCP-201ENST00000368765 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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PDK4Q16654 RPL23AP7-201ENST00000391616 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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PDK4Q16654 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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PDK4Q16654 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 LINC02296-201ENST00000557070 544 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AC015722.1-201ENST00000557499 385 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 CRTC3-AS1-201ENST00000558105 502 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AC006557.4-201ENST00000585516 830 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 LINC01198-208ENST00000599175 560 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AC244196.3-201ENST00000614171 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 LZTS1-204ENST00000616228 231 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 WDR11-AS1-207ENST00000630905 769 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 MIR3120-201ENST00000636555 81 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 MIR193BHG-210ENST00000641327 515 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PDK4Q16654 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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