Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAXBP1Q9Y5B6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms