Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
THRAP3Q9Y2W1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THRAP3Q9Y2W1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms