Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms