Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GINS2Q9Y248 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GINS2Q9Y248 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms