Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNEQ9Y223 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms