Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS5Q9UPZ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS5Q9UPZ3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms