Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TUBE1Q9UJT0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBE1Q9UJT0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms