Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJP4

KLHL21, Kelch-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL21Q9UJP4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL21Q9UJP4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL21Q9UJP4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms