Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms